1、根据季节变化调整水位。4~6月苗种放养初期，为提高水温，虾沟内保持在浅水位；7月水稻反青前期，田面水深保持在3~5cm，以利让小龙虾进入稻田觅食；8月水稻拨节后期，可将水位调至最大；水稻收割前期再将水位逐步降浅直到田面露出为止，以利水稻收割。
2、根据天气、水质变化调整水位。小龙虾生长要求池水的溶氧充足，水质清新。为满足这一要求，应坚持定期换水。一般每5~6月每7~10d换水1次，每次换水10cm左右；7~9月高温季节，每周换水1~2次，每次换水15cm左右；10月后每15~20d换1次，每次换水10cm左右。平时要注意观测，水位过浅要及时补充；水质过浓要及时换水，并应保持水位相对稳定。
3、根据晒田、治虫要求调控水位。水稻生长中期，为使空气进入土壤，田面得到阳光照射，增加水稻根系活力，同时为增温杀菌，应进行烤田。通常采用轻烤的方法是：将水位降至田面露出为宜。可适当缩短烤田时间，烤田结束后即将水位恢复。水稻在生长过程中需要喷药治虫，喷洒农药后也要根据需要更换新鲜水，以利而为水稻、小龙虾的生长提供必要的生态环境。
养虾的稻田水位管理十分重要，既要满足小龙虾生长的需求，又要服从水稻生长的需要。最低水位时，虾沟水深不得小于30cm。高温季节每天应排去部分老水，并及时补充新鲜水。若发现小龙虾抱住稻秧，侧卧于水面，则说明田水已呈缺氧状态；若发现小龙虾大批上岸，则说明田水已严重缺氧，应立即加注新鲜水，保持水质清新。
