将成熟的亲虾放入产卵设施后，暂养一段时间后，将分批产卵，抱卵虾和雄虾、未产雌虾同池高密度共处将影响受精卵孵化率和抱卵虾本身的生存。因此，水泥池或网箱等非洞穴产卵设施出现抱卵虾后，应及时分批将抱卵虾隔离出来，放入条件优越的孵化设施开展受精卵的孵化。这要求做好以下两项工作。
1、抱卵虾的收集
小龙虾亲虾的产卵环境要求尽可能地少受干扰，水泥池频繁排水或网箱不断抬起清理抱卵虾的操作，必然对小龙虾亲虾的产卵产生影响。而清理次数少，又会造成受精卵发育不齐，影响后续孵化工作。
因此，要经常检查抱卵虾出现的比率，掌握合理的抱卵虾清理频度。一般根据孵化条件和抱卵虾产出数量确定清理频度。控温孵化时，要求受精卵发育尽可能同步，3～4天清理一次比较合理；常温孵化时，7～8天清理一次较好。
2、抱卵虾的运输
同大部分受精卵一样，胚胎发育的早期，极易受到环境因子的影响。因此，受精卵从产卵设施中分离出来时，尽量避开强烈的光照，保持湿润或带水环境。清理抱卵虾时，一定要轻拿轻放，装运时单层摆放，避免相互挤压、碰撞，运输途中要避光、透气，尽可能缩短运输时间和距离。短距离可以采用干法运输，长距离运输最好带水操作。
