轮叶黑藻在小龙虾养殖中有些举足轻重的作用，它鱼伊乐藻、苦草等水草一起相互搭配种植，起着净化水体、给小龙虾提供新鲜植物性饵料、增加水体溶氧等作用。
轮叶黑藻最大的特点就是耐高温、再生能力强、不耐深水、不容易败坏水质。
在高温天气轮叶黑藻能够正常的生存，而伊乐藻在高温天气容易死亡，所以轮叶黑藻就成为了小龙虾养殖池夏季里非常合适的水草。另外，轮叶黑藻被小龙虾夹断后在水中又能够生根，所以轮叶黑藻不容易败坏水质。由于轮叶黑藻不耐深水，所以轮叶黑藻更适合种植在浅滩处。
在虾稻田种植轮叶黑藻，一般有两个时间段种植。一是在冬天十二月时候种植轮叶黑藻芽孢种子，等到开春后气温升高到十度左右时种子开始发芽生长。不过，用芽孢种子种轮叶黑藻是比较少的，大多数还是直接用轮叶黑藻的茎叶来种植，这就是轮叶黑藻的第二种种植方法。
第二种轮叶黑藻种植方法是在每年三四月份时候开始，这个时候伊乐藻进入快速生长期，可以给小龙虾提供充足的水草饵料。而且轮叶黑藻也是生长正常时期，我们可以把轮叶黑藻茎叶截成十来公分一截，然后撒在虾稻田环形沟的浅滩处，最后用脚踩入泥土中。轮叶黑藻很快就能存活并生长。这个时候要注意的就是，如果稻田里有很多小龙虾的还是要注意用围栏围住还么有长好的轮叶黑藻，避免它被小龙虾大量的蚕食。
