发病初期，龙虾体表长有黄绿色及棕色绒毛状物，行动迟缓，小龙虾会在浅水区乱跑，在深水区浮头，甚至爬到水边和岸上，对外来刺激反应慢，触角不敏感，体表黏液有滑腻感，活动异常。用显微镜观察可见钟形虫、累枝虫、斜管虫等纤毛虫类原生动物及丝状藻。发病中晚期，龙虾壳上有厚厚的附着物，鳃部挂有污泥且黏液增多，呼吸困难，鳃丝受损，继发感染细菌病，导致小龙虾食欲减退，甚至不摄食。生长发育停滞，不蜕壳，体质虚弱。解剖观察可见空肠，肝脏呈浅黄色或深褐色，肌肉无弹性，鳃呈黑色。极度衰竭，最终无力蜕壳而亡。
小龙虾感染纤毛虫的原因
1未定期改底养殖过程中，随着饲料投喂量的增加，残饵、粪便等有机质不断堆积塘底，造成底质恶化，有害菌群大量繁殖，为纤毛虫的生长提供良好的环境及营养物质。
2肥水不当经常使用肥水膏类产品肥水，肥水快速，水色往往绿爽、好看，但是容易培养可以被纤毛虫摄食的小型藻类，给纤毛虫提供大量的天然饵料，促进纤毛虫的生长繁殖。
投料不足或饵料质量差，造成小龙虾苗期营养不良，体质变差，对纤毛虫的抵抗力下降。此外，恶劣天气，池塘水质指标突变，易出现藻类大量死亡沉底、水浑等现象，使小龙虾出现应激，也会造成体质下降，同时死亡藻类又有利于纤毛虫的生长繁殖。
娟姐给出对付小龙虾纤毛虫的办法1、彻底清塘，放苗后定期使用降解型底质改良剂，减少底部污染，给纤毛虫“断粮”，同时可有效抑制虫卵。
2、及时清理水面的死藻，减少水体中的腐败物
3、在南美白对虾养殖过程中添加乐畅桉树精油，可以驱除体内外的纤毛虫，抑制水中细菌的增长。乐畅是一款安全无毒的产品，而且还可以菌虫双抗，更安全，更经济！
总之，小龙虾纤毛虫病是由水质恶化，纤毛虫大量滋生，造成危害，可以通过水体杀虫灭菌、虾体杀虫消毒、药剂拌饵投喂、清塘处理等等措施，消灭虫源，防治病害。
