小龙虾的繁殖比较特殊，繁殖的大部分过程在洞穴中完成，故在平常的生产中难以见到抱卵虾。卵巢在交配后需2-5个月方后成熟，并进行排卵受精。受精卵为紫酱色，粘附于腹部游泳肢的刚毛上，抱卵虾经常将腹部贴近洞内积水，以保持卵处于湿润状态。小龙虾的怀卵量较小，根据规格不同，怀卵量一般在100-700粒，平均为300粒。卵的孵化时间约为14-24天，但低温条件下，孵化期可长达4-5个月。
小龙虾虾苗在发育期间，不需要任何外来营养供给，刚孵出的仔虾需在亲虾腹部停留几个月左右，方脱离母体。若条件不适宜，可在洞穴中不吃不喝数周，当池塘灌水以后，仔虾和亲虾陆续从洞穴中爬出，分布在池塘中，有时亲虾会携带幼体进入水体之中，然后释放幼体。克氏螯虾虽然抱卵量较少，但幼体孵化的成活率高。由于克氏螯虾分散的繁殖习性限制了苗种的规模化生产，给集约性生产带来不利影响。
