微囊藻毒素是由蓝藻水华，如固氮的鱼腥藻、束丝藻、拟柱胞藻、胶刺藻和节球藻，非固氮的微囊藻、颤藻和鞘丝藻等暴发所产生的一种肝毒素，它对蛋白磷酸酶1和蛋白磷酸酶2A具有抑制作用，因此与肿瘤促进作用有直接关系。对于养殖小龙虾多年的养殖户说，刚开始在水塘养殖龙虾时，龙虾的个头比较大，但三四年过去了，同样的水面，收成却比往年少了一些。少的不是小龙虾的只数，而是小龙虾的重量。
对于这个说法，其实和养殖小龙虾的水质有很大的关系。淡水水体中，都会或多或少存在微囊藻毒素，这是水体富营养化的一种特征。
而小龙虾生长在淡水水体中，里面存在的这种微囊藻毒素，很可能对小龙虾的生长产生一定的影响。小龙虾受到影响后，尽管养殖户对小龙虾的喂养还和往年一样，但小龙虾的生长速度却会慢很多，因为要代谢掉这些毒素，使得小龙虾的消耗量增加。
一般情况下，在干净的水里，小龙虾一年能长七八厘米，一次可以产卵300多个，但实地调查后却发现，在水质富营养化尤其是出现大面积蓝藻水华的水体里，小龙虾生长很缓慢，繁殖率低。
微囊藻毒素如果大量在水体里产生，会造成小龙虾死亡，而由于小龙虾的抗毒性较强，如果达不到造成小龙虾死亡的量，小龙虾也能存活，但繁殖能力会降低，且长不大。
“小龙虾如果不能通过自身的新陈代谢，将身体里积蓄的毒素排解掉，人大量吃了这样的小龙虾后，会对身体产生一定的危害。”这种伤害对肝脏部位有很大的影响。因此，养殖小龙虾时，一定要注重养殖环境，要尽量减少水体中的微囊藻毒素，这样小龙虾不仅生长快，而且个头大。
