检查病虾一定要按顺序进行，以免遗漏。总的次序是先体外，后体内。常见的病害大多发生在体表、鳃和肠道三个部位，故在实际诊断中，以下三者是检查的重点。
体表
将虾放在解剖盘里，首先观察看其体色等情况，并留意外壳是否擦伤或糜烂，是否出血，是否有异常斑点等。
鳃
鳃是特别容易被病原体寄生的器官，黏菌、水霉、鳃霉、各类原生动物、单殖类和复殖类囊蚴、软体动物的幼虫、甲壳类动物等，在鳃上都可能找到。
第一步，肉眼检查。察看鳃丝色泽有无发黑、发白、肥肿;有无污泥、是否糜烂，鳃盖是否完好。
第二步，检查鳃组织、将左右两边的鳃完好取出，分开放在培养皿里，用小剪刀取一小片鳃组织，放在载玻片上，加少量清水，盖上盖玻片，在镜下检查。
取鳃丝检查时，最好从每边鳃的第一片鳃片接近两端的位置减取一小块，因为这个地方寄生虫较集中，每边鳃至少要检查2次。
肠道
检查肠道时，在肠道的前、中、后段各剪开一个小口，用小镊子从小口取出一些内含物放在载玻片上，加一小滴生理盐水，盖上盖玻片，在显微镜下检查病原生物。每段肠道要同时检查2次。
再用剪刀小心地把整条肠道剪开(留意不要把肠道内可能存在的大型寄生虫剪断)，把肠的内含物都刮下来，放在培养皿中，加入生理盐水稀释并搅均匀，在解剖镜下检查，检查肠内壁有无溃烂。
注意事项：
1、供作检查诊断用的虾，一定要用鲜活的或者刚死不久的虾。否则会因虾死太久，其组织、器官糜烂变质。原来所表现的症状无法辨别或病原体离开鱼体或死亡，从而无法正确鉴别。
2、在检查时遵循由表及里、先头后尾的原则，在解剖进程中，所分割的器官应维持其完好性，分开放置，并维持其湿润，避免干燥。同时还要避免各器官间病原体的互相污染。
3、对于不能肯定的病变标本或病原体，应留下标本，以备日后作一步研究。
